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结构模体

结构模体(英语:structural motif)也称为结构基序,是链样生物分子(如蛋白质核酸)中普遍存在且具有特征性的局部三维结构(超二级结构)单元模式。结构模体常为某种功能决定部位,可出现在各种不同的、演化上不相关的链样分子中。它们在蛋白质的生物学功能中起着重要作用,但相同的结构模体在不同蛋白质或酶中可能存在较大的功能差异。

定义

核酸或蛋白质分子上的亚序列或亚结构。通常具有某种功能。

出处

《生物化学与分子生物学名词》。

蛋白质中的结构模体

在蛋白质中,结构模体的例子包括但不限于以下几种:

- β发夹:由两个相邻的β链组成,它们通过转角连接在一起。

- 希腊钥匙:由连续的β链和α尾旋组成,形成一个紧凑的结构。

- 四股β链相互折叠形成三明治的形状:这种模体由四个β链组成,它们相互折叠形成一个稳定的三明治状结构。

- Ω环:由蛋白质链中的一部分形成的环状结构。

- 螺旋-环-螺旋:由两个α螺旋通过一个环状结构连接。

- 亮氨酸拉链:由两个α螺旋组成,它们通过亮氨酸残基相互作用形成稳定的结构。

- 螺旋-转角-螺旋:由两个α螺旋通过一个转角连接。

这些模体在蛋白质的功能中扮演着关键角色,它们可以参与蛋白质的稳定、分子间相互作用、催化反应等多种生物学过程。然而,即使是相同的结构模体,由于其所处的蛋白质环境和上下文的不同,其功能也可能有很大的差异。因此,结构模体为研究蛋白质功能提供了一个有趣且复杂的研究领域。

参考资料