异常剪接
异常剪接是指对序列库中异常剪接mRNA的鉴定和分析。
策略流程
为了鉴定和分析序列库中的异常剪接mRNA,我们提出了一套策略,旨在识别并区分天然的生物过程和实验过程中产生的错误。这一策略包括一系列的过滤规则,每个规则都具有特定的意义,需要深入理解才能正确实施。通过这套策略,我们可以发现并研究染色体易位、mRNA反式拼接、多位置转录、反义转录等多种类型的异常剪接现象。这些现象在生物学上有着重要的作用,如染色体易位可能会影响基因表达水平,甚至导致癌症的发生。反式拼接则能够调节转录效率和mRNA稳定性,以及增加蛋白质的多样性。而反义转录则已知能抑制某些基因的表达。因此,对于这些异常剪接mRNA的研究具有重要的功能意义。此外,实验操作中的错误匹配和反转录可能会引入人工的异常剪接事件,如嵌套基因和基因组污染。为了避免这些错误影响数据的有效性,我们需要将它们从序列库中筛选出来并加以纠正或丢弃。
参考资料
mRNA异常剪接体外验证实验.哔哩哔哩.2024-11-01
异常剪接.异常剪接.2024-11-21
异常剪接.知乎专栏.2024-11-21