厚囊蕨纲
孢子囊为厚囊型，由一群细胞发育而成。孢子囊壁为多层细胞，环带有或无，环带（girdle band）为孢子囊壁上一列内壁及侧壁加厚的细胞，有助于孢子囊的开裂和孢子的散布。孢子同型。本纲包括箭蕨目（瓶尔小草目Ophioglossales）和合囊蕨目（Marattiales）两个目。常见的有：瓶尔小草（Ophioglossum vulgatum L.），单叶幼时非拳卷；孢子囊穗自不育叶基部生出。羽状复叶幼时拳卷，螺旋排列成莲座状。孢子囊群生于叶背。可盆栽观赏。
分布范围
合囊蕨科为最大科，有3属，又以观音座莲属种类为多，我国约有50余种，广布长江以南各省区及西南，日本也有，生林下溪边或沟谷边。
下级分类
瓶尔小草目
较原始的类群，根状茎和根为肉质，叶二型，1至数枚，单一或多回羽状分裂，均出自总柄，在总柄的顶端（有时在叶轴下部），生出穗状或复穗状的孢子囊穗，它们是由许多圆球形的孢子囊聚生而成的，其孢子囊壁由数层细胞构成，是原始的性状之一。有3科：瓶尔小草科Ophiogiossaceae、阴地蕨科Botrychiaceae和七指蕨科Helminthostachyaceae。主要分布于北半球温带，少数分布于热带地区。三科之间的主要差别是：瓶尔小草科的叶子通常为单叶，叶脉连结成网状，孢子囊序为单穗状，孢子囊横裂；阴地蕨科的叶子为2～3回羽状分裂，叶脉分离，孢子囊序呈复穗状或圆锥状，孢子囊横裂；七指蕨科叶子掌状深裂，叶脉连结成网状，孢子囊穗长圆柱状或复穗状，孢子囊成熟时直的开裂。
莲座蕨目
根状茎肥大，叶柄基部呈托叶状，肉质，并以关节和根状茎相连；叶片通常1～2回羽状，少为掌状，羽片或小羽片也以关节着生于叶轴或小羽柄上，叶脉羽状，少为网状；孢子囊具数层细胞组成的厚壁，生叶片下面的叶脉上，形成线形或长圆形的分离孢子囊群，或圆形的聚合囊群，孢子囊无环带。有4科：合囊蕨科Marattiaceae、观音座莲科Angiopteridaceae、天星蕨科Christenseniaceae和多孔蕨科Danaeaceae。广泛分布于世界热带和亚热带森林中。前3科我国均有分布。本目在晚古生代石炭二叠纪就很发育，呈桫椤状，具巨大的羽状复叶。中生代晚三叠世，合囊蕨科和观音座莲科也有代表。