汪国华
汪国华，哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院长聘教授、博士生导师。2013年度当选教育部“新世纪优秀人才支持计划”。主持多项国家自然科学基金、国家863项目等。主要研究生物信息学、机器学习、人工智能等。
个人资料
汪国华，现任哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院教授、博士生导师，2013年度当选教育部“新世纪优秀人才支持计划”，主持多项国家自然科学基金、国家863项目等。2008年以来在国内外重要生物信息学期刊发表多篇SCI检索国际期刊论文。
人物经历
2020年9月6日上午，东北林业大学信息与计算机工程学院院长汪国华教授应吉林大学计算机科学与技术学院邀请，在计算机楼A521作了题为“A new k-mer counting algorithm and application in poplar Genome analysis ”的学术报告。
工作经历
2016年12月--，哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院，长聘教授
2014年12月--，哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院，教授
2013年4月--，哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院，博士生导师
2009年9月至2014年12月，哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院，副教授
2004年7月至2009年9月，哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院，讲师
1999年7月至2004年7月，哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院，助教
教育经历
2014年3月至2016年4月，美国约翰霍普金斯大学博士后
2006年11月至2008年11月，美国印地安那大学-普渡大学印第安纳波利斯分校访问学者
2003年9月至2009年9月，哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院，获工学博士学位
2001年9月至2003年7月，哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院，获工学硕士学位
1995年9月至1999年7月，哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院，获工学学士
研究方向
生物信息学： 脱氧核糖核酸甲基化与转录因子相互关系；等位基因上基因表达调控模型等。
生物医学大数据：大规模基因组数据组装，比对分析；单细胞测序数据分析；基因组与临床数据相结合与转化研究。
生物医学人工智能：基于人工智能方法的药物设计，生物医学图像分析与推理。
科研经历
1. 国家自然科学基金面上项目“结合甲基化 DNA 的转录因子识别及其调控功能研究”，2018.1-2021.12
2. 国家自然科学基金面上项目“基于个体基因组单核酸突变的等位基因转录调控模型研究”，2014.1-2017.12
3. 哈尔滨工业大学基础研究杰出人才培育计划“面向高通量数据的生物信息学方法研究”，2014.7-2016.7
4. 国家863项目“转化医学生物信息技术及产品研发”，2012.1-2015.12
5. 教育部新世纪人才计划“面向个人基因组的生物信息学问题研究”，2014.1-2016.12
6. 博士后国际交流计划派出项目“基因组中脱氧核糖核酸甲基化对疾病调控机制研究”，2014.4-2016.4
7. 中国博士后科学基金第五批特别资助“基于单核苷酸突变的等位基因转录调控模型研究”，2012.6-2014.12
8. 第 49 批博士后基金面上项目“基于新一代测序数据的选择性启动子预测及分析”，2011.3-2013.3
9. 国家自然科学基金青年项目“基于CHIP-SEQ数据的microRNA启动子区域预测及转录因子结合位点分析，2009.1-2012.12
10. 黑龙江省归国留学基金项目“基于微阵列数据的转录因子与microRNA调控功能研究”负责人，2009.1-2012.12
11. 国家863项目“基于微阵列数据的miRNA调控机制分析的关键方法与技术（项目编号2007AA02Z302）”副组长
主要任职
2.国际期刊《ISRN Genomics》期刊编委
3.12th International Conference on 生物信息学 of the Asia-Pacific Bioinformatics Network（InCoB2013）和12th Asia-Pacific Bioinformatics Conference（APBC2014）国际会议程序委员会成员
4.美国科学促进会( The American Association for the Advancement of Science ，美国艺术与科学院 )会员
5.中国计算机学会 (中国计算机学会夏培肃奖) 高级会员，生物信息学专委委员，中国人工智能学会会员
6.中国计算机学会CCF YOCSEF哈尔滨市分论坛学术委员
7.《现代生物出版集团 Genomics》期刊 Associate Editor
8.《Biomedical research international》期刊特约编辑
9. InCoB2013、 APBC2014、 APBC2015、 ISBRA2018 国际会议程序委员会成员
10.《BMC Genomics》、《BMC System Biology》、《Current Bioinformatics》和《Computational and Mathematical Methods in Medicine》和《Oncotarget》等生物信息学期刊审稿人
表彰经历
2013 年，教育部“新世纪优秀人才支持计划”
2011 年，中国计算机学会“2011中国计算机学会夏培肃奖 优秀博士学位论文奖提名”
2011 年，哈尔滨工业大学十三届优秀博士学位论文
2009 年，文章“Signal transducers and activators of transcription-1 (STAT1) regulates microRNA transcription in interferongamma-stimulated HeLa cells”在国际会议“Critical Assessment of Massive Data Analysis 2009” (CAMDA 2009)上获得唯一奖项“Best Presentation Award”
学术论文
SCI检索索引国际期刊：
1. Zhu H, Wang G, Qian J. Transcription factors as readers and effectors of 脱氧核糖核酸 methylation. Nature Review Genetics. 2016;17(9):551-65 (影响因子： 40.282，中科院一区，他引： 35)
2. White DT#, Eroglu AU#, Wang G#, Zhang L, Sengupta S, Ding D, Rajpurohit SK, Walker SL, Ji H, Qian J, Mumm JS. ARQiv-HTS, a versatile whole-organism screening Platform enabling in vivo drug discovery at high-throughput rates. Nature Protocol. 2016 Dec;11(12):2432-2453 (并列第一作者，影响因子： 10.032 ，中国科学院星一区，他引： 4)
3. Wang G*, Luo X, Wang J, Wan J, Xia S, Zhu H, Qian J, Wang Y. MeDReaders: a database for transcription factors that bind to methylated 脱氧核糖核酸 Nucleic Acids Res. 2018;46(D1):D146-D151 (影响因子： 10.162，中科院一区)
4. Zou Q, Hu Q, Guo M, Wang G*. HAlign: Fast multiple similar DNA/核糖核酸 sequence alignment based on the centre star strategy. 生物信息学 2015 Aug 1;31(15):2475-81 (影响因子： 7.307，中科院一区，热点论文，他引： 39)
5. Bhat-Nakshatri P, Wang G, Collins NR, Thomson MJ, Geistlinger TR, Carroll JS, 褐色 M, Hammond S, Srour EF, Liu Y, Nakshatri H. Estradiol-regulated microRNAs control estradiol response in breast cancer cells. Nucleic Acids Res. 2009; 37(14):4850-4861 (影响因子： 7.836，中科院一区，他引： 168)
6. Liu Y#, Balaraman Y#, Wang G#, Nephew KP, Zhou FC. 乙醇 exposure alters 脱氧核糖核酸 methylation profiles in mouse embryos at early neurulation. Epigenetics. 2009; 4(7):500-511. (并列第一作者，影响因子： 4.584，中科院二区，他引： 113)
7. Wang Y#, Wang G#, Yang B, Tao H, Yang JY, Deng Y, Liu Y. Reconstruct gene regulatory network using slice pattern model. BMC Genomics. 2009; 10 Suppl 1:S2. (co-first author) (并列第一作者，影响因子：4.206，中科院二区，他引：1)
8. Wang G, Wang Y, Feng W, Wang X, Yang JY, Zhao Y, Wang Y, Liu Y. Transcription factor and microRNA regulation in androgen-dependent and -independent prostate cancer cells. 现代生物出版集团 Genomics. 2008; 9 Suppl 2:S22 (影响因子： 3.759，中科院二区，他引： 30)
9. Wang G, Wang X, Wang Y, Yang JY, Li L, Nephew KP, Edenberg HJ, Zhou FC, Liu Y. Identification of transcription factor and microRNA binding sites in responsible to fetal 乙醇 Syndrome BMC Genomics. 2008; 9 Suppl 1:S19 (影响因子： 3.759，中国科学院星二区，他引： 11)
10. Bhat-Nakshatri P, Wang G, Appaiah H, Luktuke N, Carroll JS, Geistlinger TR, 褐色 M, Badve S, Liu Y, Nakshatri H. AKT alters genome-wide estrogen receptor alpha binding and impacts estrogen signaling in breast cancer. 摩尔 Cell Biol. 2008; 28(24):7487-7503 (影响因子：6.057，中科院二区，他引： 40)
11. Wang G*, Wang F, Huang Q, Li Y, Liu Y, Wang Y. Understanding Transcription Factor Regulation by Integrating Gene Expression and DNase I Hypersensitive Sites. Biomed Res Int. 2015;2015:757530 (影响因子： 2.476，中科院三区)
12. Wang G*, Liu Y, Zhu D, Klau GW, Feng W. 生物信息学 Methods and Biological Interpretation for Next-Generation Sequencing Data. Biomed Res Int. 2015; 2015:690873 (影响因子： 2.476，中科院三区)
13. Zhao Y, Zou Q; Jiang Y; Wang, G*. A Graphic Processing Unit Web Server for Computing Correlation Coefficients for Gene Expression Data. Journal of Computational and Theoretical Nanoscience, 12(4), pp 582-584 (影响因子： 1.666，中科院三区)
14. Wang G*, Qi K, Zhao Y, Li Y, Juan L, Teng M, Li L, Liu Y, Wang Y. Identification of Regulatory Regions of Bidirectional Genes in Cervical Cancer. bmc Medical Genomics. 2013;6 Suppl 1:S5 (影响因子： 2.873，中科院三区，他引： 8)
15. Wang G, Wang Y, Shen C, Huang Y, Kuang K, Huang T, Nephew K, Li L, Liu Y. 核糖核酸 Polymerase II binding patterns reveal genomic regions involved in microRNA gene regulation. PLoS ONE. 2010;5(11): e13798 (影响因子： 4.092，中科院三区，他引： 27)
16. Wang G, Wang Y, Teng M, Zhang D, Li L, Liu Y. Signal transducers and activators of transcription-1 (STAT1) regulates micro核糖核酸 transcription in interferon γ – stimulated HeLa cells. PLoS ONE. 2010; 5(7):e11794 (影响因子： 4.092，中国科学院星三区，他引： 9)
17. Zou Q, Li X, Jiang Y, Zhao Y, Wang G*. BinMemPredict: a Web server and software for predicting membrane protein types. Current Proteomics. 2013; 10(1): 2-9 (影响因子： 0.635，他引：23，中科院四区)
18. Qu K, Han K, Wu S, Wang G, Wei L. Identification of 脱氧核糖核酸-Binding Proteins Using Mixed Feature Representation Methods. Molecules. 2017 Sep 22;22(10) (影响因子： 2.861，中科院三区)
19. Liu S, Zibetti C, Wan J, Wang G, Blackshaw S, Qian J. Assessing the model transferability for prediction of transcription factor binding sites based on chromatin accessibility. BMC 生物信息学 2017 Jul 27;18(1):355 (影响因子： 2.448，中科院二区)
20. Zhao Y, Wang F, Chen S, Wan J, Wang G. Methods of MicroRNA Promoter Prediction and Transcription Factor Mediated Regulatory Network. Biomed Res Int. 2017;2017:7049406 (影响因子：影响因子： 2.476，中科院三区)
21. Peng J, Bai K, Shang X, Wang G, Xue H, Jin S, Cheng L, Wang Y, Chen J. Predicting disease-related genes using integrated biomedical networks. BMC Genomics. 2017 Jan 25;18(Suppl 1):1043 (影响因子： 3.729，中国科学院星二区，高被引论文，他引： 6)
22. Campochiaro PA, Hafiz G, Mir TA, Scott AW, Zimmer-Galler I, Shah SM, Wenick AS, Brady CJ, Han I, He L, Channa R, Poon D, Meyerle C, Aronow MB, Sodhi A, Handa JT, Kherani S, Han Y, Sophie R, Wang G, Qian J. Pro-permeability Factors in Diabetic Macular Edema; the Diabetic Macular Edema Treated With Ozurdex Trial. Am J Ophthal摩尔 2016;168:13-23(影响因子： 5.052，中科院二区)
23. Zou Q, Li J, Song L, Zeng X, Wang G. Similarity computation strategies in the microRNA-disease network: a survey. Brief Funct Genomics. 2015 Jul 1. pii: elv024 (影响因子： 4.098，中科院二区，高被引论文，他引： 51)
24. oliver VF, Jaffe AE, Song J, Wang G, Zhang P, Branham KE, Swaroop A, Eberhart CG, Zack DJ, Qian J, Merbs SL. Differential 脱氧核糖核酸 methylation identified in the blood and retina of AMD patients. Epigenetics. 2015;10(8):698-707 (影响因子： 4.394，中科院二区，他引： 8)
25. Wan J, oliver VF, Wang G, Zhu H, Zack DJ, Merbs SL, Qian J. Characterization of tissue-specific differential DNA methylation suggests distinct modes of positive and negative gene expression regulation. BMC Genomics. 2015 Feb 5;16:49 (影响因子： 3.729，中科院二区，他引： 30)
26. Campochiaro PA, Hafiz G, Mir TA, Scott AW, Sophie R, Shah SM, Ying HS, Lu L, Chen C, Campbell JP, Kherani S, Zimmer-Galler I, Wenick A, Han I, Paulus Y, Sodhi A, Wang G, Qian J. Pro-permeability Factors After Dexamethasone Implant in Retinal Vein Occlusion; The Ozurdex for Retinal Vein Occlusion (ORVO) Study. Am J Ophthal摩尔 2015 Oct 16. pii: S0002-9394(15)00604-2 (影响因子： 5.052，中国科学院星二区，他引： 6)
27. Zhang D, Wang G, Wang Y. Transcriptional regulation prediction of antiestrogen resistance in breast cancer based on RNA polymerase II binding data. BMC 生物信息学 2014;15 Suppl 2:S10 (影响因子： 2.435，中科院二区，他引： 1)
28. Zhu S, Wang G, Liu B, Wang Y. Modeling exon expression using histone modifications. PLoS ONE. 2013; 8(6): e67448 (影响因子： 3.234，中科院三区，他引： 4)
29. Cheng L, Wang G, Li J, Zhang T, Xu P, Wang Y. SIDD: A Semantically Integrated Database towards a Global View of Human Disease. PLoS One. 2013;8(10):e75504 (影响因子： 3.234，中科院三区，他引： 10)
30. Jiang Q, Wang G, S Jin, Y Li, Wang Y*. Predicting human microRNA-disease associations based on support vector machine. International Journal of Data Mining and 生物信息学. 2013; 8(3):282-293 (影响因子： 0.495，他引： 22，中科院四区)
31. Juan L, Wang G, Radovich M, Schneider BP, Clare SE, Wang Y, Liu Y. Potential roles of microRNAs in regulating long intergenic noncoding RNAs. BMC Medical Genomics. 2013;6 Suppl 1:S7 (影响因子： 2.873，中科院三区，他引： 40)
32. Teng M, Wang Y, Kim S, Li L, Shen C, Wang G, Liu Y, Huang T, Nephew KP, Balch C. Empirical Bayes model comparisons for differential methylation analysis. Comparative and Functional Genomics, 2012:376706 ( 影响因子： 1.747，中科院四区，他引： 1)
33. Zhu S, Jiang Q, Wang G, Liu B, Teng M, Wang Y. Chromatin structure characteristics of pre-miRNA genomic sequences. BMC Genomics. 2011 Jun 25;12:329 (影响因子： 4.397，中科院二区，他引： 5)
34. Shen C, Huang Y, Liu Y, Wang G, Zhao Y, Wang Z, Teng M, Wang Y, Flockhart DA, Skaar TC, Yan P, Nephew KP, Huang TH, Li L. A modulated Empirical Bayes Model for Identifying Topological and Temporal Estrogen Receptor alpha Regulatory Networks in Breast Cancer. BMC Syst Biol. 2011;5(1):67 (影响因子： 2.982，中科院二区，他引： 16)
35. Patel JB, Appaiah HN, Burnett RM, Bhat-Nakshatri P, Wang G, Mehta R, Badve S, Thomson MJ, Hammond S, Steeg P, Liu Y, Nakshatri H. Control of EVI-1 oncogene expression in metastatic breast cancer cells through micro核糖核酸 miR-22. Oncogene. 2011; 30(11):1290-1301 (影响因子：7.357，中科院一区，他引： 63)
36. Jiang Q, Hao Y, Wang G, Juan L, Zhang T, Teng M, Liu Y, Wang Y. Prioritization of disease microRNAs through a human phenome-microRNAome network. BMC Syst Biol. 2010; 4 Suppl 1:S2 (影响因子： 3.148，中科院二区，他引： 90)
37. Wang X, Wang K, Radovich M, Wang Y, Wang G, Feng W, Sanford JR, Liu Y. Genome-wide prediction of cis-acting RNA elements regulating tissue-specific pre-mRNA alternative splicing. BMC Genomics. 2009; 10 Suppl 1:S4 (影响因子： 4.206，中科院二区，他引： 8)
38. Jiang Q, Wang Y, Hao Y, Juan L, Teng M, Zhang X, Li M, Wang G, Liu Y. miR2Disease: a manually curated database for microRNA deregulation in human disease. Nucleic Acids Res. 2009; 37(Database issue):D98-104 (影响因子： 7.836，中科院一区，高被引论文，他引： 494 )
39. Wang X, Wang G, Shen C, Li L, Wang X, Mooney SD, Edenberg HJ, Sanford JR, Liu Y. Using RNase sequence specificity to refine the identification of 核糖核酸protein binding regions. BMC Genomics. 2008; 9 Suppl 1:S17 (影响因子： 3.759，中科院二区，他引： 6)
其它国际期刊及会议文章：
40. Teng M, Wang Y, Wang G, Jung J, Edenberg H, Sanford J, Liu Y. Prioritizing single-核苷酸 variations that potentially regulate alternative splicing BMC Proceedings, 2011; 5(Suppl 9):s40
41. Jiang Q, Wang G, Wang Y. An approach for prioritizing disease-related micro核糖核酸s based on genomic data integration. The 3rd International Conference on BioMedical Engineering and Informatics (BMEI'10). 2010. p2270-2274 (EI 检索)
42. Jiang Q, Wang G, Zhang T, Wang Y. Predicting human microRNA-disease associations based on support vector machine. 2010 IEEE International Conference on 生物信息学 and Biomedicine (BIBM'10). 2010. p467-472
43. Jiang Q, Hao Y, Wang G, Zhang T, Wang Y. Weighted network-based inference of human microRNA-disease associations. The 5th International Conference on Frontier of Computer Science and Technology. 2010. p431-435 (EI 检索)
44. Wang X, Teng M, Wang G, Zhao Y, Han X, Feng W, Li L, Sanford J, Liu Y, xIP-seq platform: an integrative framework for high-throughput sequencing data analysis. 2009 Ohio Collaborative Conference on Bioinformatics, OCCBIO 2009. p26-31 (EI 检索)
45. Wang X, Wang K, Wang G, Sanford J, Liu Y. Model-based prediction of cis-acting RNA elements regulating tissue-specific alternative splicing. 8th IEEE International Conference on 生物信息学 and BioEngineering, BIBE 2008. p1-6 (EI 检索)
46. Chen AB, Hamamura K, Wang G, Xing W, Mohan S, Yokota H, Liu Y. Model-based comparative prediction of transcription-factor binding motifs in anabolic responses in bone. Genomics Proteomics 生物信息学 2007; 5(3-4):158-165.
47. Guo-hua Wang, Ya-Dong Wang, Mao-Zu Guo. An 本体论based method for similarity calculating between concepts in the semantic web. Proceedings of the fifth International Conference on Machine Learning and Cybernetics 2006. p1538-1542 (EI 检索)
参考资料
计算机科学与技术专家讲座系列报道（汪国华）-吉林大学计算机科学与技术学院.吉林大学计算机科学与技术学院.2022-01-25